MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Selenomonas ruminantium subsp. lactilytica TAM6421

Total Repeats: 62925

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017068	TAT	2	6	57	62	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017068	TTG	2	6	75	80	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017068	GGA	2	6	118	123	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017068	ATA	2	6	196	201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017068	A	7	7	228	234	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017068	GAA	2	6	392	397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383752829
7	NC_017068	A	6	6	500	505	100 %	0 %	0 %	0 %	383752829
8	NC_017068	GCA	2	6	530	535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383752829
9	NC_017068	GAA	3	9	539	547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383752829
10	NC_017068	A	6	6	572	577	100 %	0 %	0 %	0 %	383752829
11	NC_017068	CTC	2	6	676	681	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383752829
12	NC_017068	AAT	2	6	728	733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752829
13	NC_017068	CTT	2	6	790	795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383752829
14	NC_017068	TATG	2	8	796	803	25 %	50 %	25 %	0 %	383752829
15	NC_017068	ATC	2	6	917	922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752829
16	NC_017068	CAG	2	6	932	937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383752829
17	NC_017068	GAA	2	6	1031	1036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383752829
18	NC_017068	TTC	2	6	1037	1042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383752829
19	NC_017068	ATG	2	6	1062	1067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752829
20	NC_017068	TCA	2	6	1080	1085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752829
21	NC_017068	GAA	2	6	1124	1129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383752829
22	NC_017068	CGA	2	6	1243	1248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383752829
23	NC_017068	ATC	2	6	1424	1429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752829
24	NC_017068	CTT	2	6	1443	1448	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383752829
25	NC_017068	AGA	2	6	1465	1470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383752829
26	NC_017068	AAG	2	6	1481	1486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383752829
27	NC_017068	CTT	2	6	1573	1578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383752829
28	NC_017068	CGG	2	6	1579	1584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383752829
29	NC_017068	ACC	2	6	1595	1600	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383752829
30	NC_017068	ATCA	2	8	1622	1629	50 %	25 %	0 %	25 %	383752829
31	NC_017068	TGAA	2	8	1665	1672	50 %	25 %	25 %	0 %	383752829
32	NC_017068	ATGTC	2	10	1873	1882	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
33	NC_017068	CTA	4	12	1909	1920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_017068	TATT	2	8	1925	1932	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017068	TA	3	6	1933	1938	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017068	A	7	7	1955	1961	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017068	CCA	2	6	2027	2032	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383752830
38	NC_017068	CCA	2	6	2114	2119	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383752830
39	NC_017068	CCT	2	6	2133	2138	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383752830
40	NC_017068	GCA	2	6	2303	2308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383752830
41	NC_017068	GCT	2	6	2447	2452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383752830
42	NC_017068	GCT	2	6	2485	2490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383752830
43	NC_017068	ATC	2	6	2554	2559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752830
44	NC_017068	GCT	2	6	2574	2579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383752830
45	NC_017068	ATCAG	2	10	2642	2651	40 %	20 %	20 %	20 %	383752830
46	NC_017068	TGA	2	6	2661	2666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752830
47	NC_017068	GGC	2	6	2806	2811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383752830
48	NC_017068	CTT	2	6	2861	2866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383752830
49	NC_017068	GAA	2	6	2890	2895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383752830
50	NC_017068	GATG	2	8	2955	2962	25 %	25 %	50 %	0 %	383752830
51	NC_017068	GAA	2	6	3081	3086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383752830
52	NC_017068	AGG	2	6	3090	3095	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383752830
53	NC_017068	GCG	2	6	3186	3191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383752831
54	NC_017068	CGC	3	9	3251	3259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383752831
55	NC_017068	GTG	2	6	3270	3275	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383752831
56	NC_017068	AGC	2	6	3509	3514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383752832
57	NC_017068	TTCAG	2	10	3572	3581	20 %	40 %	20 %	20 %	383752832
58	NC_017068	CGG	2	6	3592	3597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383752832
59	NC_017068	ACC	2	6	3614	3619	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383752832
60	NC_017068	TGG	2	6	3638	3643	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383752832
61	NC_017068	T	6	6	3662	3667	0 %	100 %	0 %	0 %	383752832
62	NC_017068	T	6	6	3717	3722	0 %	100 %	0 %	0 %	383752832
63	NC_017068	TCAG	2	8	3734	3741	25 %	25 %	25 %	25 %	383752832
64	NC_017068	GAA	2	6	3810	3815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383752832
65	NC_017068	GGC	2	6	3870	3875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383752832
66	NC_017068	AGG	2	6	3905	3910	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383752832
67	NC_017068	GCG	2	6	3948	3953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383752832
68	NC_017068	TAA	2	6	4044	4049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752832
69	NC_017068	GAT	2	6	4114	4119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752832
70	NC_017068	ATC	2	6	4120	4125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752832
71	NC_017068	CAG	2	6	4171	4176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383752832
72	NC_017068	GAT	2	6	4258	4263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752832
73	NC_017068	TGA	2	6	4265	4270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752832
74	NC_017068	GAT	2	6	4335	4340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752832
75	NC_017068	TCA	2	6	4500	4505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752833
76	NC_017068	A	7	7	4523	4529	100 %	0 %	0 %	0 %	383752833
77	NC_017068	TAT	2	6	4531	4536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752833
78	NC_017068	ATA	2	6	4589	4594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752833
79	NC_017068	GAAT	2	8	4656	4663	50 %	25 %	25 %	0 %	383752833
80	NC_017068	GAT	3	9	4668	4676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752833
81	NC_017068	GATT	2	8	4718	4725	25 %	50 %	25 %	0 %	383752833
82	NC_017068	GAA	2	6	4807	4812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383752833
83	NC_017068	ACG	2	6	4827	4832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383752833
84	NC_017068	GGC	2	6	4863	4868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383752833
85	NC_017068	TGA	2	6	4890	4895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752833
86	NC_017068	GCC	2	6	5035	5040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383752833
87	NC_017068	AGC	2	6	5042	5047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383752833
88	NC_017068	ATG	2	6	5167	5172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752833
89	NC_017068	GCA	2	6	5175	5180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383752833
90	NC_017068	GCC	2	6	5256	5261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383752833
91	NC_017068	AGC	2	6	5264	5269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383752833
92	NC_017068	ATA	2	6	5279	5284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752833
93	NC_017068	GAG	2	6	5373	5378	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383752833
94	NC_017068	AGC	2	6	5499	5504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383752834
95	NC_017068	GAG	2	6	5548	5553	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383752834
96	NC_017068	ATC	2	6	5569	5574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752834
97	NC_017068	GCG	2	6	5622	5627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383752834
98	NC_017068	GGC	2	6	5667	5672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383752834
99	NC_017068	GATG	2	8	5676	5683	25 %	25 %	50 %	0 %	383752834
100	NC_017068	CTG	2	6	5684	5689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383752834
101	NC_017068	ATG	2	6	5703	5708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752834
102	NC_017068	GAA	2	6	5772	5777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383752835
103	NC_017068	ACC	2	6	5793	5798	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383752835
104	NC_017068	AGC	2	6	5823	5828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383752835
105	NC_017068	CAGATC	2	12	5868	5879	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	383752835
106	NC_017068	GTAT	2	8	5914	5921	25 %	50 %	25 %	0 %	383752835
107	NC_017068	GCA	2	6	5926	5931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383752835
108	NC_017068	AGT	2	6	5966	5971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752835
109	NC_017068	CGA	2	6	5984	5989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383752835
110	NC_017068	CCAT	2	8	6025	6032	25 %	25 %	0 %	50 %	383752835
111	NC_017068	CATG	2	8	6083	6090	25 %	25 %	25 %	25 %	383752835
112	NC_017068	CCG	2	6	6103	6108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383752835
113	NC_017068	CGG	2	6	6137	6142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383752835
114	NC_017068	CGG	2	6	6173	6178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383752835
115	NC_017068	GT	3	6	6193	6198	0 %	50 %	50 %	0 %	383752835
116	NC_017068	CGT	2	6	6200	6205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383752835
117	NC_017068	TCT	2	6	6361	6366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383752835
118	NC_017068	GAC	2	6	6371	6376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383752835
119	NC_017068	ATG	2	6	6451	6456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752835
120	NC_017068	GGC	2	6	6498	6503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383752835
121	NC_017068	AAG	2	6	6534	6539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383752835
122	NC_017068	GAT	2	6	6582	6587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752835
123	NC_017068	GGC	2	6	6672	6677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383752835
124	NC_017068	TGC	2	6	6713	6718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383752835
125	NC_017068	TGA	2	6	6776	6781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752835
126	NC_017068	TCA	2	6	6805	6810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752835
127	NC_017068	AGACCA	2	12	6844	6855	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	383752835
128	NC_017068	TC	3	6	6908	6913	0 %	50 %	0 %	50 %	383752835
129	NC_017068	GAA	2	6	6924	6929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383752835
130	NC_017068	TGCCCG	2	12	6974	6985	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	383752835
131	NC_017068	GCAAG	2	10	6997	7006	40 %	0 %	40 %	20 %	383752835
132	NC_017068	ATCT	2	8	7098	7105	25 %	50 %	0 %	25 %	383752835
133	NC_017068	GGC	2	6	7125	7130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383752835
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255	NC_017068	A	8	8	13000	13007	100 %	0 %	0 %	0 %	383752839
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259	NC_017068	AAAG	2	8	13325	13332	75 %	0 %	25 %	0 %	383752840
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262	NC_017068	TAT	2	6	13394	13399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752840
263	NC_017068	GGC	2	6	13497	13502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383752840
264	NC_017068	TCA	2	6	13510	13515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752840
265	NC_017068	TCA	2	6	13600	13605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752840
266	NC_017068	TGA	2	6	13646	13651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752840
267	NC_017068	GAA	2	6	13679	13684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383752840
268	NC_017068	GAA	2	6	13733	13738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383752840
269	NC_017068	TGG	2	6	13867	13872	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383752840
270	NC_017068	GC	3	6	13875	13880	0 %	0 %	50 %	50 %	383752840
271	NC_017068	GCA	2	6	13939	13944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383752840
272	NC_017068	AGC	2	6	13978	13983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383752840
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275	NC_017068	TGGAA	2	10	14056	14065	40 %	20 %	40 %	0 %	383752840
276	NC_017068	TGG	2	6	14071	14076	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383752840
277	NC_017068	CTAT	2	8	14104	14111	25 %	50 %	0 %	25 %	383752840
278	NC_017068	TGA	2	6	14114	14119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752840
279	NC_017068	GGCA	2	8	14123	14130	25 %	0 %	50 %	25 %	383752840
280	NC_017068	TCA	3	9	14191	14199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752840
281	NC_017068	GGGC	2	8	14223	14230	0 %	0 %	75 %	25 %	383752840
282	NC_017068	GCC	2	6	14353	14358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383752840
283	NC_017068	TAC	2	6	14448	14453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752840
284	NC_017068	ATC	2	6	14487	14492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752840
285	NC_017068	CTT	2	6	14534	14539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383752840
286	NC_017068	GTTC	2	8	14587	14594	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
287	NC_017068	TGGC	2	8	14596	14603	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
288	NC_017068	GGC	2	6	14606	14611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
289	NC_017068	GTG	2	6	14616	14621	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
290	NC_017068	AAT	2	6	14651	14656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
291	NC_017068	ATT	2	6	14740	14745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
292	NC_017068	ACC	2	6	14782	14787	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
293	NC_017068	GCC	2	6	14791	14796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
294	NC_017068	TTG	2	6	14823	14828	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
295	NC_017068	GTA	2	6	14835	14840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
296	NC_017068	T	6	6	14953	14958	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
297	NC_017068	AGG	2	6	14993	14998	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
298	NC_017068	TGG	2	6	15047	15052	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383752841
299	NC_017068	GAA	2	6	15114	15119	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383752841
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374	NC_017068	CTT	2	6	18547	18552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
375	NC_017068	TCT	2	6	18570	18575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
376	NC_017068	ATA	2	6	18589	18594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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378	NC_017068	ATA	2	6	18629	18634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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381	NC_017068	TTG	2	6	18736	18741	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
382	NC_017068	TTC	2	6	18766	18771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
383	NC_017068	AAC	2	6	18772	18777	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
384	NC_017068	ATG	2	6	18802	18807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
385	NC_017068	ATT	2	6	18862	18867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
386	NC_017068	ATAA	2	8	18952	18959	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
387	NC_017068	ATT	2	6	19134	19139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
388	NC_017068	GAA	2	6	19209	19214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
389	NC_017068	GCA	2	6	19275	19280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383752843
390	NC_017068	TTG	3	9	19293	19301	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383752843
391	NC_017068	ATA	2	6	19366	19371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752843
392	NC_017068	AGA	2	6	19372	19377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383752843
393	NC_017068	GGT	2	6	19392	19397	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383752843
394	NC_017068	CGTAT	2	10	19416	19425	20 %	40 %	20 %	20 %	383752843
395	NC_017068	CCA	2	6	19438	19443	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383752843
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397	NC_017068	CGG	2	6	19475	19480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383752843
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399	NC_017068	TCT	2	6	19487	19492	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383752843
400	NC_017068	GGA	2	6	19535	19540	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383752843
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403	NC_017068	CTG	2	6	19683	19688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383752843
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424	NC_017068	GGCG	2	8	20434	20441	0 %	0 %	75 %	25 %	383752844
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430	NC_017068	GCC	2	6	20639	20644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383752844
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434	NC_017068	A	7	7	20795	20801	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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452	NC_017068	ACA	2	6	21559	21564	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
453	NC_017068	A	6	6	21586	21591	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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492	NC_017068	T	7	7	23673	23679	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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